MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhodoferax ferrireducens T118 plasmid1

Total Repeats: 748

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007901	TGT	2	6	5101	5106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007901	ATTG	2	8	9673	9680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007901	GT	3	6	9762	9767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007901	GTG	2	6	9771	9776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007901	CGT	2	6	9803	9808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007901	ACACA	2	10	12380	12389	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_007901	CAG	2	6	12417	12422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_007901	GCC	2	6	12435	12440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_007901	TGC	3	9	12450	12458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_007901	CAC	2	6	12906	12911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_007901	TGC	2	6	12961	12966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_007901	A	9	9	15676	15684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007901	TC	3	6	15685	15690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_007901	ACT	2	6	19906	19911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_007901	GAA	2	6	25033	25038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007901	GGC	2	6	25104	25109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007901	G	6	6	25118	25123	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007901	CA	3	6	25982	25987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007901	ATC	2	6	26049	26054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_007901	TGGCT	2	10	26097	26106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007901	A	6	6	26117	26122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007901	GGC	2	6	26123	26128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_007901	TGG	2	6	26129	26134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007901	ACC	2	6	26170	26175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_007901	TTGG	2	8	26191	26198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_007901	TGTTT	2	10	26216	26225	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007901	A	6	6	26271	26276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007901	GC	3	6	26299	26304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_007901	GTTTT	2	10	27219	27228	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_007901	T	6	6	27225	27230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007901	TAA	2	6	28890	28895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007901	CGA	2	6	28927	28932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007901	CGC	2	6	28943	28948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_007901	TCCCC	2	10	28993	29002	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
35	NC_007901	AGGG	2	8	29007	29014	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_007901	GAA	2	6	29027	29032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007901	TTCT	2	8	29040	29047	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_007901	AAG	2	6	32040	32045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007901	GTG	2	6	32069	32074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007901	CGA	2	6	32122	32127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_007901	TGCCTT	2	12	32151	32162	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007901	GCC	2	6	32236	32241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_007901	CGA	2	6	32264	32269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_007901	CGGGT	2	10	32398	32407	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_007901	GCT	2	6	32423	32428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_007901	AAC	2	6	32469	32474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007901	AAGG	2	8	32550	32557	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007901	T	6	6	34113	34118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007901	CG	3	6	34125	34130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_007901	TGTC	2	8	34140	34147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_007901	GCT	2	6	36611	36616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_007901	GGC	3	9	36625	36633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_007901	T	6	6	36737	36742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007901	AGAA	2	8	36811	36818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007901	CGGCT	2	10	36862	36871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_007901	GCA	2	6	36889	36894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007901	AC	3	6	37034	37039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_007901	ATG	2	6	37046	37051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007901	AAAC	2	8	37135	37142	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_007901	AT	3	6	37170	37175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007901	T	7	7	37283	37289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007901	ACT	2	6	37294	37299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_007901	CGTTT	2	10	37326	37335	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_007901	AGT	2	6	37339	37344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007901	TC	3	6	37347	37352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_007901	GTT	2	6	38250	38255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007901	TTTG	2	8	43144	43151	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_007901	ATT	2	6	43178	43183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007901	CAA	2	6	43213	43218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007901	GTT	2	6	43482	43487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007901	GTC	2	6	43535	43540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_007901	TGG	2	6	43561	43566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007901	GGT	2	6	43667	43672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007901	AAC	2	6	43725	43730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007901	TATT	2	8	43736	43743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007901	GCC	2	6	43761	43766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_007901	ATT	2	6	43831	43836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007901	GCA	2	6	43870	43875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007901	TCA	2	6	43917	43922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007901	GAG	2	6	44068	44073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007901	TGG	2	6	44259	44264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007901	CTG	2	6	44359	44364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_007901	T	6	6	44420	44425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007901	T	7	7	44507	44513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007901	TCT	2	6	44559	44564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007901	TTG	2	6	44598	44603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_007901	CGG	2	6	46633	46638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007901	ATT	2	6	46677	46682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_007901	CAA	2	6	46714	46719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_007901	CGGGT	2	10	46725	46734	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_007901	TC	3	6	46739	46744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_007901	TGG	3	9	46900	46908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_007901	CAG	2	6	49244	49249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007901	CCT	2	6	49280	49285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_007901	AC	3	6	49718	49723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_007901	T	6	6	49755	49760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007901	ATAA	2	8	49763	49770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007901	AAC	2	6	49811	49816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_007901	GTT	2	6	49848	49853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007901	GTT	2	6	49857	49862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007901	TGG	2	6	49888	49893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007901	GGT	2	6	50032	50037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007901	GCG	2	6	50078	50083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_007901	CAT	2	6	50203	50208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_007901	GGTG	2	8	50257	50264	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007901	GCC	2	6	50267	50272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_007901	GAC	2	6	50287	50292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_007901	CTG	2	6	50301	50306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007901	AAG	2	6	50344	50349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007901	A	6	6	50366	50371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007901	TGC	3	9	50451	50459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007901	CAC	2	6	50461	50466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_007901	TGCC	2	8	50518	50525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007901	CGG	2	6	52987	52992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007901	CGG	2	6	52994	52999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007901	AGA	2	6	53027	53032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007901	GCC	2	6	53066	53071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_007901	AGC	2	6	53109	53114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_007901	TTG	2	6	54630	54635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007901	T	7	7	54692	54698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007901	AGA	2	6	54725	54730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007901	AAAG	2	8	54733	54740	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007901	TGA	2	6	54917	54922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007901	CGC	2	6	54994	54999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_007901	GGGA	2	8	55036	55043	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007901	ACC	2	6	55052	55057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_007901	CAAC	2	8	55071	55078	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007901	GC	3	6	55149	55154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_007901	TCAA	2	8	55221	55228	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_007901	CAG	2	6	55300	55305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_007901	TCAA	2	8	55370	55377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_007901	GCG	2	6	55398	55403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_007901	AAGAC	2	10	55510	55519	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007901	AACA	2	8	55527	55534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_007901	CAG	2	6	55722	55727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007901	AAGAC	2	10	55766	55775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_007901	TCAA	2	8	55791	55798	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_007901	CAAC	2	8	55898	55905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_007901	AAGAC	2	10	55965	55974	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_007901	TCAA	2	8	55990	55997	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_007901	GCG	2	6	56018	56023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007901	CAAC	2	8	56097	56104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_007901	A	8	8	56312	56319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007901	AC	3	6	56327	56332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007901	GT	3	6	56340	56345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_007901	CGA	3	9	61641	61649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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148	NC_007901	A	6	6	61816	61821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_007901	GAAA	2	8	61879	61886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_007901	CTGC	2	8	61977	61984	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_007901	T	7	7	62097	62103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_007901	C	6	6	63248	63253	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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